Ο θάνατος του εκλιπόντος, που είχε δημιουργήσει από κοινού με τα δυο αδέρφια του την εταιρεία «ΒΙΑΝΕΞ», οφείλεται σε ανακοπή καρδιάς. 

Πέρα από το οικογενειακό του περιβάλλον, ο χαμός του Κώστα Γιαννακόπουλου βύθισε στο πένθος και τον Παναθηναϊκό, καθώς ο ίδιος μπορεί να μην ασχολήθηκε ποτέ επίσημα, ωστόσο βρισκόταν κοντά στον σύλλογο και προσέφερε σε αυτόν μακριά από τη δημοσιότητα.